Procedura uwzględnia zasady obierania oraz przechowywania faktur od podmiotów krajowych oraz zagranicznych wraz z modelowym rozwiązaniem w zakresie sprawowania kontroli nad obiegiem dokumentów. Procedura obejmuje również kwestie związane z kwestionowaniem otrzymanych faktur w sytuacji, gdy faktury jest ona niezgodna z zaistniałym stanem faktycznym, pochodzi od nieznanego kontrahenta lub została udostępniona w formie wizualizacji bez wystąpienia przesłanek ustawowych.