Na co muszą przygotować się podatnicy w zakresie cen transferowych w roku 2026

Rok 2026 zapowiada się jako okres istotnego wzmożenia kontroli podatkowych w obszarze cen transferowych. Zarówno zapowiedzi Ministerstwa Finansów, jak i dotychczasowa praktyka Krajowej Administracji Skarbowej wskazują, że ten obszar pozostaje jednym z kluczowych priorytetów kontrolnych administracji skarbowej. 

Jednocześnie należy podkreślić, że część zmian, które istotnie wpłyną na sposób prowadzenia kontroli, nie musi być w pełni odczuwalna już w 2026 roku, lecz ujawni swój rzeczywisty potencjał dopiero w kolejnych latach – wraz z kumulacją i analitycznym wykorzystaniem danych raportowych. 

Spis treści 

1. Ceny transferowe w centrum zainteresowania fiskusa 
2. Dlaczego kontrole będą bardziej intensywne i selektywne 
3. KSeF, JPK-CIT i ujawnienie danych – nowa jakość kontroli podatkowych 
4. Efekt odroczony – realne konsekwencje w kolejnych latach 
5. Obszary szczególnego ryzyka 
6. Konsekwencje kontroli 
7. Jak przygotować się na nową rzeczywistość  
8. Podsumowanie 
   
   

Ceny transferowe w centrum zainteresowania fiskusa 

Ceny transferowe od lat są postrzegane przez organy podatkowe jako obszar podwyższonego ryzyka. Szczególną uwagę przyciągają transakcje pomiędzy podmiotami powiązanymi, zwłaszcza w zakresie usług niematerialnych, restrukturyzacji grup kapitałowych oraz finansowania wewnątrzgrupowego. W praktyce kontrolnej coraz częściej analizowana jest nie tylko wysokość wynagrodzenia, lecz również realność świadczeń oraz ich uzasadnienie ekonomiczne. 

W 2026 roku administracja skarbowa będzie w coraz większym stopniu korzystać z danych pochodzących z formularzy TPR, raportów MDR, międzynarodowej wymiany informacji podatkowych, a także z JPK-CIT, który dostarcza szczegółowych danych finansowych i podatkowych na poziomie księgowym. 

Dlaczego kontrole będą bardziej intensywne i selektywne 

Wzrost liczby i jakości kontroli jest efektem kilku równoległych procesów. Po pierwsze, KAS dysponuje coraz bardziej zaawansowanymi narzędziami analitycznymi, umożliwiającymi identyfikację ryzyk bez konieczności prowadzenia klasycznych czynności sprawdzających. Po drugie, ceny transferowe pozostają obszarem, w którym potencjalne doszacowania są relatywnie wysokie. Po trzecie, organy coraz szerzej interpretują pojęcie powiązań, uwzględniając nie tylko relacje kapitałowe, lecz także osobowe i faktyczny wpływ na decyzje gospodarcze. 

Istotną rolę odgrywa również JPK-CIT, który pozwala organom na analizę rentowności, struktury kosztów, marż oraz rozliczeń wewnątrzgrupowych w sposób ustandaryzowany i porównywalny pomiędzy podatnikami. 

W tym kontekście pod szczególną obserwacją znajdują się modele, w których osoby fizyczne prowadzące JDG świadczą usługi na rzecz własnych spółek lub podmiotów, na które mają istotny wpływ. 

KSeF, JPK-CIT i ujawnienie danych – nowa jakość kontroli podatkowych 

Istotnym czynnikiem zmieniającym sposób prowadzenia kontroli jest Krajowy System e-Faktur (KSeF), a w ujęciu systemowym także JPKCIT. Choć ich pełne wykorzystanie analityczne nie musi natychmiast przełożyć się na falę kontroli w 2026 roku, to zakres, szczegółowość i porównywalność danych tworzą zupełnie nową rzeczywistość nadzorczą. 

Warto też pamiętać o terminach raportowania: KSeF obowiązkowo dla dużych podatników od 1 lutego 2026 r., a dla pozostałych podatników od 1 kwietnia 2026 r.; natomiast JPKCIT za rok podatkowy 2025 należy złożyć w terminie złożenia rocznego CIT, czyli zwykle do 31 marca 2026 r. 

Dzięki KSeF organy podatkowe uzyskują dostęp do ustrukturyzowanych danych fakturowych w czasie zbliżonym do rzeczywistego, natomiast JPKCIT umożliwia powiązanie tych danych z wynikiem podatkowym i strukturą finansową podatnika. W praktyce oznacza to możliwość automatycznego porównywania cen i zakresów usług, analizy częstotliwości i powtarzalności transakcji oraz identyfikowania rozbieżności pomiędzy fakturowaniem, dokumentacją TP a wynikiem podatkowym. 

Kontrola coraz rzadziej będzie polegała na gromadzeniu dokumentów, a coraz częściej na analizie danych, które organy już posiadają. 

Efekt odroczony – realne konsekwencje w kolejnych latach 

Choć 2026 rok może być postrzegany jako okres przejściowy, rzeczywisty potencjał analityczny danych z KSeF, TPR i JPK-CIT ujawni się w kolejnych miesiącach. Organy podatkowe będą budować profile ryzyka w oparciu o dane historyczne, co pozwoli na: 

• wszczynanie kontroli obejmujących kilka lat wstecz, 
• precyzyjne kwestionowanie konkretnych transakcji, 
• łatwiejsze wykazywanie nierynkowego charakteru rozliczeń. 

Z tego powodu rok 2026 powinien być traktowany jako kluczowy z punktu widzenia potwierdzenia bezpieczeństwa rozliczeń podatkowych, zarówno pod kątem prawidłowego ujawnienia danych w JPKCIT, jak i pełnego korzystania z KSeF. Właściwe raportowanie i transparentność rozliczeń już w tym roku pozwolą podatnikom zminimalizować ryzyko kwestionowania transakcji przez organy podatkowe oraz przygotować się na kontrole w kolejnych latach. 

Obszary szczególnego ryzyka 

W praktyce kontrolnej szczególną uwagę organów będą przyciągać: 

• usługi niematerialne, w przypadku których badana jest nie tylko cena, lecz także realność i wartość dodana, 
• powiązania osobowe i faktyczny wpływ na decyzje spółki, 
• jakość i adekwatność analiz porównawczych, 
• spójność danych pomiędzy dokumentacją cen transferowych, TPR, JPK-CIT oraz fakturami raportowanymi w KSeF. 
  
  

Konsekwencje kontroli 

Kontrola w zakresie cen transferowych może prowadzić nie tylko do doszacowania dochodu i naliczenia odsetek, lecz również do zastosowania sankcyjnych stawek podatkowych oraz odpowiedzialności karnoskarbowej osób zarządzających. W praktyce ryzyko to dotyczy także rozliczeń za kilka lat wstecz. 

Jak przygotować się na nową rzeczywistość 

Najskuteczniejszym sposobem ograniczenia ryzyka jest przygotowanie się jeszcze przed kontrolą. Obejmuje to w szczególności aktualizację dokumentacji cen transferowych, weryfikację rynkowości rozliczeń, zapewnienie spójności danych raportowych (TPR, JPK-CIT, KSeF) oraz identyfikację faktycznych powiązań i wpływów decyzyjnych. 

Podsumowanie 

Rok 2026 należy postrzegać nie tylko jako czas wzmożonych kontroli, lecz także jako początek nowej jakości nadzoru podatkowego, opartego na masowym dostępie do danych i zaawansowanej analityce. 

Podatnicy, którzy już dziś zadbają o transparentność, rynkowość i spójność rozliczeń – także pomiędzy dokumentacją TP, JPK-CIT i KSeF – znacząco ograniczą ryzyko w kolejnych latach, gdy możliwości kontrolne administracji skarbowej będą jeszcze większe.