Spółka posiadająca zagraniczne oddziały zobowiązana jest ujmować dane dotyczące takich oddziałów w JPK CIT.

W stanie prawnym obowiązującym od 1 stycznia 2025 r. podatnicy prowadzący księgi rachunkowe będą obowiązani prowadzić księgi rachunkowe przy użyciu programów komputerowych i przesyłać je w formie jednolitego pliku kontrolnego, czyli tzw. JPK CIT.  

Jeżeli polskie spółki posiadają zagraniczne oddziały, które są wyodrębnionymi organizacyjnie jednostkami, zasadniczo nie są zobowiązane do prowadzenia ksiąg rachunkowych dla takich zagranicznych oddziałów w Polsce. W praktyce oznacza to, że spółka prowadzi w Polsce księgi rachunkowe zgodnie z polską ustawą o rachunkowości w odniesieniu do działalności prowadzonej w Polsce. Natomiast oddziały stosują zakresie przepisy obowiązujące w miejscu siedziby danego oddziału. W związku z tym są zobligowane do prowadzenia ksiąg rachunkowych i sporządzania samodzielnego sprawozdania finansowego, co oznacza, że oddziały prowadzą własne księgi rachunkowe, odrębne od jednostki macierzystej, sporządzają samodzielnie sprawozdanie finansowe, korzystają z oddzielnego systemu finansowo-księgowego, w którym rejestrowane są wszystkie zdarzenia dotyczące oddziałów. 

Wobec takiej formy prowadzenia księgowości, polskie spółki posiadające tego rodzaju zagraniczne oddziały powzięły wątpliwości, czy wobec obowiązku prowadzenia ksiąg w formie pliku JPK CIT, zobowiązane będą uwzględniać dane dotyczące działalności i rozliczeń oddziałów.  

Odpowiedź na wątpliwości podatnika w tym zakresie znalazła odzwierciedlenie w interpretacji z dnia 6 lutego 2026 r., nr 0111-KDIB2-1.4010.585.2025.1.AJ. 

Organ przytoczył przepisy ustawy o rachunkowości, z których wywnioskował, że ustawa ta w żadnym miejscu nie przewiduje wyłączenia obowiązku prowadzenia ksiąg rachunkowych zgodnie z jej przepisami dla wyodrębnionych jednostek organizacyjnych mających siedzibę w innych krajach, takich jak zagraniczne oddziały. 

Wobec czego, w ocenie organu, podmiotem obowiązanym do prowadzenia ksiąg rachunkowych, również w zakresie samobilansujących zagranicznych oddziałów jest Spółka. Tym samym na Spółce ciążą obowiązki wynikające z art. 9 ust. 1c ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych, czyli prowadzenie ksiąg przy użyciu programów komputerowych oraz przesyłanie ich właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego po zakończeniu roku podatkowego. 

W konsekwencji księgi rachunkowe prowadzone dla potrzeb samobilansujących zagranicznych oddziałów jako stanowiące element ksiąg podatnika i służące ustaleniu podstawy opodatkowania podatkiem dochodowym od osób prawnych, podlegają przekazaniu w strukturze logicznej pliku JPK CIT.  

Ponadto organ uznał, że skoro księgi obejmujące działalność zagranicznych oddziałów samobilansujących podlegają przekazaniu w ramach JPK CIT, to co do zasady podlegają one również obowiązkowi uzupełnienia o dodatkowe dane, o których mowa w Rozporządzeniu Ministra Finansów z 16 sierpnia 2024 r. w sprawie dodatkowych danych. 

Wskazać należy, że przytoczona interpretacja nie jest nowością. Również w interpretacji z dnia 3 października 2025 r., nr 0111-KDWB.4010.100.2025.1.KKM oraz z dnia 23 października 2025 r., nr 0111-KDIB2-1.4010.387.2025.1.BJ, Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej uznał, że podmiotem obowiązanym do prowadzenia ksiąg rachunkowych, również w zakresie samobilansujących się zagranicznych oddziałów jest polska spółka. Tym samym na spółce ciążą obowiązki wynikające z art. 9 ust. 1c ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych, czyli prowadzenie ksiąg przy użyciu programów komputerowych oraz przesyłanie ich właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego po zakończeniu roku podatkowego, także w odniesieniu do samobilansujących się zagranicznych oddziałów Spółki. 

W praktyce, stanowisko Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej oznaczać będzie konieczność prowadzenia przez oddziały zagraniczne podwójnych ksiąg rachunkowych - za granicą na podstawie miejscowych przepisów, a także w Polsce na podstawie ustawy o rachunkowości.  

Prowadzi to do nałożenia na podatnika obowiązku przesłania ksiąg rachunkowych, których podatnicy nie są zobowiązani prowadzić na podstawie odrębnych przepisów i których faktycznie nie prowadzą. 

Mając na uwadze wydawane interpretacje, wydaje się, że bez jednoznacznej interwencji ustawodawcy polegającej na zwolnieniu z obowiązku przesyłania JPK CIT w odniesieniu do zagranicznych zakładów polskich spółek, podatnicy posiadający takie oddziały muszą przygotować się na realizację obowiązków sprawozdawczych zgodnie z oczekiwaniami organów.  

Przypomnieć przy tym należy, że co prawda terminy do przesyłania JPK CIT zostały wydłużone do końca siódmego miesiąca po zakończeniu roku podatkowego albo roku obrotowego na mocy Rozporządzenia, które zostało podpisane przez Ministra Finansów 17 lutego 2026 r. jednak nie oznacza wyłączenia w tym okresie obowiązku prowadzenia ewidencji w takiej formie. Publikacja rozporządzenia oznacza tylko, że termin pierwszego raportowania rozumianego jako przesłanie pliku przypadnie na 31 lipca 2026 r. 

Natomiast księgi muszą być już prowadzone zgodnie z nowymi wymogami za rok obrotowy rozpoczynający się po: 

• 31 grudnia 2024 r. – dla podatkowych grup kapitałowych oraz podatników i spółek niebędących osobami prawnymi, których przychody w poprzednim roku przekroczyły 50 mln euro; 

• 31 grudnia 2025 r. – dla podatników i spółek nie będących osobami prawnymi, zarejestrowanych jako czynni podatnicy VAT, rozliczających się miesięcznie; 

• 31 grudnia 2026 roku – dla pozostałych podatników i spółek niebędących osobami prawnymi. 

Wobec czego samo wydłużenie terminu przesyłania ksiąg, niezwalania z obowiązku ich prowadzenia w formie pliku JPK CIT już w okresie trwającego roku podatkowego (zatem dla największych podatników już w 2025 r.).